Um diagnóstico diferencial preciso da periodontite apical e lesões não endodônticas deve ser estabelecido para definir um melhor plano de tratamento do caso. O cisto do ducto nasopalatino (CDNP) é um cisto de desenvolvimento não-odontogênico com incidência rara que pode levar a um erro de diagnóstico sendo confundido com lesões periapicais relacionadas aos incisivos superiores. O presente estudo descreve um caso clínico de uma paciente que foi encaminhada para realização de tratamento endodôntico nos elementos 12, 11, 21 e 22, pois a mesma apresentava grande radiolucência periapical na região dos incisivos superiores e características semelhantes à de periodontite apical. O elemento 11 já havia sido previamente acessado por outro profissional. Após exame clínico, foi constatada vitalidade pulpar nos elementos 12, 21 e 22. O tratamento endodôntico foi finalizado no elemento 11. Um exame de TCFC foi solicitado para o planejamento cirúrgico do caso. Após o tratamento cirúrgico e enucleação da lesão foi realizado o exame histopatológico que confirmou o diagnóstico de CDNP. Mediante o presente relato de caso, fica enfatizado a necessidade da execução de uma anamnese e avaliação clínica correta, com a utilização de testes e exames complementares necessários para avaliação e planejamento do caso, prevenindo dessa forma uma conduta inapropriada ou desnecessária para o caso.